Современные методы оценки микробиоты
Сегодня разберем основные современные методы оценки микробиоты кишечника, т.к. уже всем известно о существовании взаимосвязи кишечник-мозг:
- ХМС по Осипову, кровь (биотоп «тонкая кишка»)
Микроорганизмы, населяющие тонкий кишечник, образуют вещества, которые проникают сквозь стенки кишечника в кровоток. По этим метаболитам в крови можно косвенно судить о составе пристеночной микробиоты тонкого кишечника (по тонкому кишечнику это единственный легкодоступный метод).
- ХМС по Осипову, кал (биотоп «толстая кишка»)
Микроорганизмы, населяющие толстый кишечник, образуют различные метаболиты. По содержанию этих веществ в кале можно косвенно судить о составе просветной микробиоты толстого кишечника.
- 16S РНК—секвенирование
Состав и соотношение микроорганизмов, населяющих толстый кишечник, определяются на основании содержания их генетического материала в кале. Метод очень точный, охватывает тысячи видов микроорганизмов, которые невозможно выявить другими известными методами.
- Анализ кала на дисбактериоз
Образцы стула помещаются в специальную питательную среду в чашке Петри. Через несколько дней проверяют, какие колонии микроорганизмов выросли. На основании этого делается вывод о чрезмерном или недостаточном количестве определенных бактерий.
Но проблема в том, что в ЖКТ обитает несколько тысяч видов бактерий. И всего лишь 20-30 видов могут размножаться в чашке Петри в лаборатории. Остальные бактерии в таких условиях просто не растут. Соответственно, если они не обнаружены в этом анализе, это НЕ значит, что их там не было. Прежде всего, это касается группы анаэробных бактерий, которые быстро погибают при доступе кислорода (например, клостридии).
Большой плюс: можно проверить чувствительность к антибиотикам и бактериофагам, если обнаружена патогенная микрофлора.
- Биохимический анализ кала
В кале определяется содержание короткоцепочечных жирных кислот (КЖК), которые производит микрофлора (уксусная, пропионовая, масляная и др.). По количеству и соотношениям различных КЖК можно предположить дисбалансы между разными видами и родами бактерий. Например, уксусная активно производится бифидобактериями, лактобактериями, актиномицетами и др., пропионовая – пропионовокислыми бактериями и т.д.
- Органические кислоты мочи
По содержанию некоторых оргкислот в моче можно косвенно судить о дисбиозе: гиппуровая, арабиноза, винная, 3-индолилуксусная, 4-крезол, HPHPA и др.
Могут применяться специфические тесты по различным патогенам, например:
- ПЦР тесты (в биоматериале ищут ДНК конкретного патогена)
- Иммуноглобулины IgA, IgM, IgG к разным патогенам (показывают, как иммунная система реагирует на патоген)
- Определение специфических токсинов в биоматериале (например, токсины А и В Clostridium Difficile)
- Другие
У каждого метода есть свои особенности, плюсы и минусы.
Ещё рекомендую:
Различные полезные материалы для скачивания
Бесплатные вебинары, интенсивы, марафоны по аутизму
Курс по методам коррекции аутизма
Группа в WhatsApp для вопросов
Предупреждение. Информация на всех моих ресурсах носит обучающий/ознакомительный характер и не является медицинским советом. Необходима консультация лечащего врача.